Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms