Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms