Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bace1P56818 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms