Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms