Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rrp1P56183 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrp1P56183 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms