Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms