Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms