Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fgf9P54130 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms