Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms