Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms