Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms