Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx3P50481 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx3P50481 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx3P50481 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx3P50481 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx3P50481 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx3P50481 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx3P50481 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms