Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrp3P50462 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrp3P50462 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms