Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc13P50207 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms