Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LmnaP48678 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LmnaP48678 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms