Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GdnfP48540 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GdnfP48540 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GdnfP48540 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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