Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms