Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd4P46935 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms