Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms