Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtgfrP43117 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms