Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf1P39428 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf1P39428 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf1P39428 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms