Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms