Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1aP36536 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1aP36536 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms