Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprkP35822 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprkP35822 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprkP35822 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprkP35822 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprkP35822 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprkP35822 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms