Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddit3P35639 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms