Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rfc1P35601 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms