Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpoP35419 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpoP35419 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpoP35419 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpoP35419 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpoP35419 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpoP35419 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpoP35419 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TpoP35419 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpoP35419 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpoP35419 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms