Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms