Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Notch4P31695 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms