Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd1P30999 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms