Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms