Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms