Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms