Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdgfraP26618 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms