Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U2af2P26369 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms