Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms