Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3aP23979 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htr3aP23979 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms