Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PparaP23204 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PparaP23204 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PparaP23204 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PparaP23204 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PparaP23204 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PparaP23204 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PparaP23204 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PparaP23204 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PparaP23204 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PparaP23204 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PparaP23204 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PparaP23204 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms