Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RarbP22605 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RarbP22605 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RarbP22605 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RarbP22605 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RarbP22605 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RarbP22605 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RarbP22605 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RarbP22605 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RarbP22605 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RarbP22605 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RarbP22605 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RarbP22605 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RarbP22605 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms