Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms