Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms