Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkceP16054 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkceP16054 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkceP16054 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkceP16054 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms