Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rag1P15919 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms