Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SptbP15508 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms