Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrphP15331 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrphP15331 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrphP15331 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrphP15331 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrphP15331 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms