Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms