Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnp2P11378 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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