Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP11369 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP11369 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP11369 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP11369 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP11369 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP11369 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP11369 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolP11369 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PolP11369 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PolP11369 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PolP11369 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PolP11369 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PolP11369 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PolP11369 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolP11369 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolP11369 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolP11369 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms