Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spp1P10923 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spp1P10923 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms