Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem254aP0DN89 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem254aP0DN89 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms